İddialara göre Abdurrahman Yılmaz 1994 yılı başlarında İlçe Jandarma Komutanlığı ile birlikte çalıştıkları iddia edilen Abdulhakim Güven, Adem Yakin, Cabbar ve Ramazan Hoca kod adlarıyla bilinen kişiler tarafından uzun süreli tehditlere maruz kalmıştır.

06-07.02.1994 tarihlerinden itibaren ailesi Abdurrahman Yılmaz’dan haber alamamaya başlamıştır.

14.02.1994 tarihinde Abdurrahman Yılmaz’ın bedeni Cizre Şırnak karayolu Dirsekli köyü sınırları içinde bir yol kenarında bulunmuş ve ailesi cenazesinin Cizre Devlet Hastanesine götürüldüğünü öğrenmiştir.

15.02.1994 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 1994/101 hazırlık numarası ile soruşturma başlatmış ve olay yeri keşif ve ölü muayene ve otopsi tutanağını düzenlemiştir. Yapılan otopside sağ kulak arkasında iki kurşun deliği ve boynunda ip izleri bulunduğu tespit edilmiş olup detaylı otopsi yapılmasına gerek olmadığı kayıtlara geçirilmiştir.

Taziyenin dördüncü gününde Yılmaz ailesinin evine gelen Ramazan Hoca ve Cabbar kod adlı kişiler, ailenin en büyük erkek çocuğunu tehdit etmiştir. Bu olaydan sonra Yılmaz ailesinin evine bir daha baskın yapılmamış ancak aile, çocuklarının da başına bir şey gelmesinden korktuğu için herhangi bir hukuki takip başlatmamıştır.

04.07.1994 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı görevsizlik kararı (Karar No: 1994/179) vermiş, dosyanın görevli mahkeme olan Diyarbakır DGM Cumhuriyet Başsavcılığına gönderilmesine karar vermiştir.

Abdurrahman Yılmaz öldürüldükten üç dört ay sonra o dönem Cizre'de müteahhitlik yapan ve evi Yılmaz ailesi ile komşu olan bir kişi Akide Yılmaz'a kocası Abdurrahman Yılmaz'ı, öldürüldüğünü duyduktan birkaç gün önce, Cizre köprüsü civarında polis karakoluna yakın bir yerde gördüğünü, kendisine ne beklediğini sorduğunda "Bir ifadem var, geleceğim," dediğini, on dakika kadar sonra da kemik rengi bir Toros marka araçla gelen sivil giyimli 4-5 kişinin kocasını da alarak gittiğini gördüğünü anlatmıştır.

2009 yılında cezaevinde tutuklu bulunan iki gizli tanığın, terörle mücadele adı altında faaliyet yürüten bir suç örgütünün varlığından bahsedip işlenen suçlar hakkında ayrıntılı bilgiler vermesi üzerine CMK 250. maddesi ile görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı 2009/906 hazırlık numaralı bir soruşturma başlatmıştır. Savcılığın, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/430 soruşturma numaralı dosyası ile birlikte yürüttüğü bu soruşturmanın ciddiyetle üzerine düşülmesi sonucu, tanık anlatımlarının birçok eski dosya bilgileri ile örtüştüğü görülerek, önemli kanıtlara ulaşılmış ve şüphelilerin bir kısmı tutuklanmıştır. Yaşanan gelişmelerin duyulmasıyla bölge kamuoyunda sorumluların tespit edilip yargılanabileceği umudu doğmuştur. Bu nedenle 2009 yılında Cizre, Silopi ve İdil ilçelerinde pek çok aile Şırnak Barosu aracılığıyla ve gönüllü avukatların desteğiyle kendi kayıplarının da akıbetlerini öğrenebilmek ve sorumluların bulunması amacıyla uzun süredir hiçbir ilerleme olmamış kayıp dosyaları ile ilgili olarak savcılıklara yeniden başvuru yapmıştır.

30.03.2009 tarihinde CMK m. 250 ile görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından 2009/906 numaralı soruşturma kapsamında Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına yazılan yazıda Cizre’de 1990-2000 yılları arasında jandarma ve polis bölgelerinde meydana gelen faili meçhul cinayetler ve zorla kaybetmelerle ilgili ayrıntılı bir tablo hazırlanması, 1993-1994 yıllarına ait nezarethane kayıt defterlerinin ve aynı yıllara ait İlçe Jandarma Komutanlığı tarafından İl Jandarma Komutanlığına gönderilen vukuat raporlarının temin edilmesi, tanık Mehmet Nuri Binzet ve gizli tanık Tükenmez Kalem’in beyanlarında yer alan olaylarla ilgili yürütülen soruşturma dosyalarından Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında bulunanlar kapsamında tanık beyanlarının yeniden alınması, fotoğraf teşhis ve fethi kabir işlemlerinin gerçekleştirilmesi, kimlik tespiti açısından gerekliyse biyolojik incelemelerin yapılması, mermi çekirdek ve kovanlarının gerekli kriminal incelemelerinin tamamlanması talep edilmiştir.

31.03.2009 tarihinde Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 2009/430 numaralı soruşturma kapsamında bu taleplerin yerine getirilmesini Cizre İlçe Emniyet Müdürlüğü ve İlçe Jandarma Komutanlığından istemiştir.

24.04.2009 tarihinde Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından yürütülen 2009/430 numaralı soruşturma kapsamında CMK m. 250 ile görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına 30.03.2009 tarihli talebinin sonucu bildirilmiştir.

02.05.2009 tarihinde, bu gelişmeler üzerine müşteki/mağdur Hişyar Yılmaz, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına, babası Abdurrahman Yılmaz'ın zorla kaybedilmesi olayı ile ilgili olarak şikâyet dilekçesi vermiştir. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı Abdurrahman Yılmaz’ın öldürülmesi iddiasını 2009/430 numaralı soruşturma dosyası altında incelemeye başlamıştır.

22.05.2009 tarihinde Hişyar Yılmaz Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında müşteki sıfatıyla ifadesini vermiştir.

25.05.2009 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına müşteki Hişyar Yılmaz vekilince dilekçe verilmek suretiyle Hişyar Yılmaz'ın tekrar dinlenmesi istenmiş ve aynı gün Hişyar Yılmaz yeniden dinlenmiştir. Yılmaz ikinci ifadesinde, Abdurrahman Yılmaz’ın Cizre köprüsü üzerinde bekletilirken kemik renginde Toros marka araçla gelen 4-5 sivil kişi tarafından alınıp götürüldüğünü, olayı kendi mahallelerinde oturan Hamza Danışman’ın gördüğünü, bunu akrabalarına sorarak öğrendiğini ve bu kişinin tanık olarak dinlenmesini talep ettiğini belirtmiştir.

26.05.2009 tarihinde, Abdurrahman Yılmaz’ın eşi Akide Yılmaz ve görgü tanığı Hamza Danışman Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında tanık olarak dinlenmiştir. Hamza Danışman ifadesinde, Hişyar Yılmaz’ın iddialarını doğrulamıştır.

Müştekiler dilekçe ve ifadelerinde Abdurrahman Yılmaz'ın gözaltına alınarak daha sonra öldürülmesinde rol aldığından şüphelendikleri Cabbar kod adlı kişinin Cizre'den tanıdıkları bir ailenin kızı ile evlendiğini öğrendiklerini belirtip nüfus kayıtlarından gerekli araştırmanın yapılarak Cabbar kod adlı kişinin gerçek kimliğinin tespit edilmesini talep etmişlerdir. Savcılığın soruşturma dosyasına da giren kayıtlara göre, Cabbar kod adıyla bilinen kişinin Kars Kağızman nüfusuna kayıtlı 01.12.1968 doğumlu İbrahim Yüce olma ihtimali bulunmaktadır.

25.03.2010 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, CMK 250. maddesi ile görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına 2009/430 numarası üzerinden yürütülen soruşturmaya ilişkin tahkikat aşamasını ve değerlendirmelerini göndermiştir. Buna göre öncelikle CMK 250. maddesi ile görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/906 numaralı soruşturma üzerinden yürüttüğü ve daha sonradan Cizre Cumhuriyet Başsavcılığınca yürütülen soruşturma dosyasının 2009/430 numarasına kaydedildiği belirtilmiştir. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı değerlendirmesinde, Abdullah Düşkün’ün öldürülmesi iddiası ile ilgili elde edilen bilgiler ve değerlendirmeler paylaşılmıştır.

18.05.2012 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı ayırma kararı vermiştir. Buna göre CMK 250. maddesi ile görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/906 numarası üzerinden yürütülen soruşturmanın Cizre Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/430 numarası üzerinden yürütülmesine karar verilmiştir.

06.02.2013 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 2009/430 numaralı soruşturmasını tamamlayarak, fezlekeyle TMK m. 10 ile görevli ve yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına göndermiştir. TMK m. 10 ile görevli ve yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığında dosya 2013/466 soruşturma numarasına kaydedilmiştir.

20.03.2014 tarihinde, TMK m. 10 ile görevli ve yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı, 6526 sayılı yasanın 19. maddesi ile TMK m. 10 ile yetkili Cumhuriyet Başsavcılıklarının görevine son verilmesi sebebiyle, yetkisizlik kararı vererek 2013/466 numaralı soruşturma dosyasını Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına göndermiş, dosya burada 2014/1859 sayılı soruşturma sırasına kaydedilmiştir.

18.10.2014 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, 2014/1859-02 numaralı soruşturma dosyası kapsamında, Cizre Emniyet Müdürlüğüne yazdığı yazıda, aralarında Abdurrahman Yılmaz’ın da bulunduğu 21 maktulün öldürülmesi iddiasına ilişkin olarak; maktullerin ölümleri veya kaybolmaları iddiasına ilişkin olarak herhangi bir şüpheli tespit edilip edilmediği, tespit edilmişse bu şüpheli hakkında ne tür işlemler yapıldığının tespit edilmesi, kayıtların tetkiki ile maktullerin ölümleri veya kaybolmaları iddiasına ilişkin olarak Cizre Emniyet Müdürlüğüne herhangi bir şikayetin yapılıp yapılmadığı, yapılmışsa bu konuda ne tür işlemler yapıldığının tespiti, bu işlemler sırasında gerekiyorsa, maktul yakınları ile görüşülmesi ve yardım alınması, olay yerinin Jandarma bölgesinde bulunması halinde, gönderilen müzekkerenin iade edilmemesi ve Jandarma görevlileri ile koordinatlı bir şekilde bu işlemlerin yapılması, soruşturmaya konu olaya ilişkin olarak Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında 11 klasör halinde evraklar mevcut olup gerekirse irtibata geçilerek belgelerin tahsis edilmesi taleplerinde bulunmuştur.

.....04.2015 tarihinde, Cizre Emniyet Müdürlüğü, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına, ilgili soruşturmaya ilişkin hazırladığı 30.03.2015 tarihli “Arşiv Araştırma Tutanağı”nı göndermiştir. Buna göre, soruşturma evrakına konu ölümlerin veya kaybolmaların akıbeti ile ilgili olarak Asayiş Büro Amirliği, Şehit Murat Akançay Polis Merkez Amirliği ve Cizre İlçe Jandarma Komutanlığı ile soruşturma konusuyla ilgili olarak gerekli araştırmanın yapılması için yazışmalar yapılmış, Şehit Murat Akançay Polis Merkez Amirliği ve Cizre İlçe Jandarma Komutanlığı ile yapılan yazışmalardan henüz yanıt gelmemiş, yanıt gelmesi halinde gönderileceği belirtilmiştir. Asayiş Büro Amirliğinin cevap yazısı ve TEM Büro Amirliği arşiv kayıtlarında yapılan araştırma neticesinde hazırlanan araştırma tutanağı gönderilmiştir. Araştırma tutanağında ise, Abdurrahman Yılmaz isimli şahıs hakkında arşiv kayıtlarında herhangi bir belge ve bilgiye rastlanmadığı ifade edilmiştir.

14.05.2015 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, ayrıca, 2014/1859 numaralı soruşturma dosyası kapsamında, Cizre İlçe Emniyet Müdürlüğünden; Abdurrahman Yılmaz isimli maktulün 1994 yılında Cizre ilçesinde öldürülmesi olayı ile ilgili olarak bugüne kadar herhangi bir fail tespit edilip edilmediği ve konu ile ilgili olarak herhangi bir kamu davası açılıp açılmadığının tespitini talep etmiştir. Soruşturmanın bu tarihten sonraki akıbeti bilinmemektedir.