Cumartesi İnsanları’nın 19 Nisan 2014 tarihli açıklamasına ve babasının ifade tutanaklarına göre; Mehmet Zeki Doğan, Hakkari’nin Çukurca ilçesindeki Çukurca Lisesi’nde gece bekçiliği yapıyordu. 7 Haziran 1994 tarihinde Özel Harekat polisleri tarafından gece saatlerinde liseye bir operasyon düzenlendi ve Mehmet Zeki Doğan zırhlı bir araca bindirilerek gözaltına alındı. Doğan’ın zırhlı araca bindirilerek gözaltına alındığı liseye yakın oturan çevre sakinleri tarafından görüldü. Gözaltına alındıktan sonra kendisinden bir daha haber alınamadı.

Gözaltına alınmasının ertesi günü Çukurca sakinleri, Mehmet Zeki Doğan’ı aramaya başladı. Arama çalışmaları sonucu Zap Suyu’nun Büya Mende bölgesinde Çukurca Kalesi’nin arka tarafında Mehmet Zeki Doğan’a ait olan ayakkabı teki ve ceket bulundu. Babasının ifadelerine göre söz konusu bölge askeri birliklerin kontrolü altında bulunuyor ve bölgede gerek gündüz gerekse gece askerlerce nöbet tutuluyordu; arama çalışmaları da askerlerden izin alınarak yapılmıştı.

O gece yaşananlara tanık olan Narlı köyü sakinlerinin ifadelerine göre, gece Zap Suyu kıyısına zırhlı bir araç gelip durdu. Arkasından silah sesleri duyuldu ve yaklaşık yarım saat sonra araç bulunduğu yerden ayrıldı. Çukurca sakinleri bu bilgiyi edindikten sonra arama yapmak için Zap Suyu kıyısına gittiklerinde kan birikintisi ve boş kovanlarla karşılaştılar. Ancak Mehmet Zeki Doğan’ın bedenini bulamadılar. Karşılaştıkları görüntü, kanın Mehmet Zeki Doğan’a ait olduğu ve boş kovanların onu vuran silahtan çıktığı ihtimallerinin güçlenmesine yol açtı. Mehmet Zeki Doğan’ın vurularak öldürüldükten sonra Zap Suyu’na atıldığını düşündüler ancak nehirdeki araştırmalarından da bir sonuç alamadılar.

Mehmet Zeki Doğan’ın abisinin belirttiğine göre, köy sakinleri Mehmet Zeki Doğan’ı aramaya çıkmadan önce resmi kurumlardan izin aldı. Ayrıca babasının beyanlarına göre Mehmet Zeki Doğan’ın ailesi tarafından, kayıp olduğu resmi makamlara ve jandarmaya bildirildi. Dolayısıyla resmi kurumların konuya ilişkin bilgisi bulunuyordu. Konuyla ilgili herhangi bir soruşturma başlatılmadı. Abisi, o dönemde yakınları zorla kaybedilen diğerleri gibi kendilerinin de aynı şeyin başlarına gelmesi korkusunu yaşadığını belirtti.