Abdullah Turğut’un ailesi olayın gerçekleştiği tarihten bir süre sonra Silopi Cumhuriyet Başsavcılığına suç duyurusunda bulundu. Yapılan başvuru üzerine 1995/1092 sayılı soruşturma başlatıldı. Ancak bir sonuç alınamadı.

2008 yılı sonunda Şırnak Barosu avukatlarının 90’lı yıllardaki zorla kaybetme olaylarının aydınlatılmasına ilişkin Cumhuriyet Savcılığına yaptığı başvuru sonrasında Silopi Cumhuriyet Başsavcılığınca 2008/3151 sayılı soruşturma başlatıldı. İddiaya konu eylemlerin soruşturulması yetki ve görevinin Özel Yetkili Cumhuriyet Başsavcılığına ait olması sebebiyle soruşturmanın Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından verilecek talimatlar yoluyla Silopi Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından yürütülmesine karar verildi. Çeşitli gazetelerde, başlatılan soruşturma kapsamında kazılar yapılacağına dair çıkan haberler üzerine savcılıklara, 54 kişinin kaybedildiği veya öldürüldüğü iddiası ile 57 kişi tarafından başvuru yapıldı. Başvuranlar arasında bulunan S. Turğut, 2008/3151 numaralı soruşturma kapsamında, 27 Ocak 2009 tarihinde Silopi Cumhuriyet Başsavcılığında müşteki sıfatıyla ifade verdi ve babasının öldürülmesinden sorumlu olanların bulunmasını talep etti.

Silopi Cumhuriyet Başsavcılığı, Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığından aldığı talimatlarla yürüttüğü araştırmaları sonucu hazırladığı fezlekeyi 23 Haziran 2009 tarihinde Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına gönderdi. Dosya Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından 2009/2117 soruşturma sayısıyla yürütülmeye başlandı. 06 Mart 2014 tarihinde Resmi Gazete’de kabul edilerek yasalaşan 6526 Sayılı Kanun ile TMK 10. maddesi ile görevli cumhuriyet başsavcılıklarının görevlerine son verilmesi üzerine Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı, 20 Mart 2014 tarihinde 2014/10160 sayılı yetkisizlik kararı verdi. Dosya, Silopi Cumhuriyet Başsavcılığına yollandı ve 2014/939 soruşturma numarasıyla takip edilmeye başlandı.

09 Nisan 2014 tarihinde Silopi Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından S. Turğut ile beraber dokuz başvurucunun daha yakınlarını öldüren/zorla kaybeden failler hakkında daimi arama kararı verildi.

Haziran 2023 yılında yapılan incelemeye göre; Silopi Cumhuriyet Başsavcılığı 2014/939 numaralı dosyasının mevcut halinde yalnızca Yusuf Kalenderoğlu, Mehmet Dansık ve Ahmet Dansık görülmüştür. Bunun dışındaki kişilerin zorla kaybedilmesine ilişkin dosya 2014/980 numaralı farklı bir dosyada görüldü.

Silopi Cumhuriyet Başsavcılığındaki 2014/939 numaralı dosyada daimi arama kararı alınmış ve dosya zamanaşımı bürosuna gönderilmiştir. 19 Haziran 2018’de Silopi İlçe Jandarma Komutanlığı 23507909-0410-8514 sayı numaralı araştırma tutanağı ile daimi arama kararına istinaden yapılan incelemede BOTAŞ askeri tesislerinde JİTEM örgütünce öldürülen 57 kayıp ile ilgili faillerin tespit edilemediği; olayı aydınlatacak iz emare bulunamadığı; bulunursa bilgi verileceği konusunda Silopi Cumhuriyet Başsavcılığına bildirimde bulunulmuştur. Her üç ayda bir bu cevaplar benzer şekilde verilmeye devam etmektedir. Bu daimi arama cevapları Silopi Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından 09 Nisan 2014 ve 2014/939 sayılı karara istinaden verilmektedir.

2014/980 soruşturma numaralı dosyayı incelemek amacıyla Silopi Cumhuriyet Başsavcılığına inceleme talebi sunuldu. Savcılık talebi kabul etmesine rağmen arşivde ve diğer alanlarda dosya hiçbir şekilde bulunamamıştır. Bunun üzerine savcı ile görüşüldü. Savcı, dosyada herhangi bir işlemin yapılmadığını, daimi arama kararı verildiğini ve dosyanın zamanaşımı süresinin dolması beklenerek zamanaşımı bürosuna tevdi edildiğini aktardı. Silopi’de bulunan 2014/939 ve 2014/980 dosyalarının ikisi de zamanaşımı bürosuna tevdii edilmiş ve dosyalarda daimi arama kararları mevcuttur. Haziran 2023 itibariyle günceldir.