İddialara göre Abdurrahman Yılmaz 1994 yılı başlarında İlçe Jandarma Komutanlığı ile birlikte çalıştıkları iddia edilen A.G., A.Y., Cabbar ve Ramazan Hoca kod adlarıyla bilinen kişiler tarafından uzun süreli tehditlere maruz kalmıştı. 6-7 Şubat 1994 tarihlerinden itibaren ailesi Abdurrahman Yılmaz’dan haber alamamaya başladı.

14 Şubat 1994 tarihinde Abdurrahman Yılmaz’ın bedeni Cizre-Şırnak Karayolu Dirsekli köyü sınırları içinde bir yol kenarında bulunmuş ve ailesi cenazesinin Cizre Devlet Hastanesine götürüldüğünü öğrenmişti.
15 Şubat 1994 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 1994/101 hazırlık numarası ile soruşturma başlatmış ve olay yeri keşif ve ölü muayene ve otopsi tutanağını düzenlemiştir. Yapılan otopside sağ kulak arkasında iki kurşun deliği ve boynunda ip izleri bulunduğu tespit edilmiş olup detaylı otopsi yapılmasına gerek olmadığı kayıtlara geçirilmişti.

4 Temmuz 1994 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı görevsizlik kararı (Karar No: 1994/179) vermiş, dosyanın görevli mahkeme olan Diyarbakır Devlet Güvenlik Mahkemesi Cumhuriyet Başsavcılığına gönderilmesine karar vermişti.

2009 yılında cezaevinde tutuklu bulunan iki gizli tanığın, terörle mücadele adı altında faaliyet yürüten bir suç örgütünün varlığından bahsedip işlenen suçlar hakkında ayrıntılı bilgiler vermesi üzerine CMK 250. Maddesinde Belirtilen Suçlara Bakmakla Yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı 2009/906 hazırlık numaralı bir soruşturma başlatmıştı. Savcılığın, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/430 soruşturma numaralı dosyası ile birlikte yürüttüğü bu soruşturmanın ciddiyetle üzerine düşülmesi sonucu, tanık anlatımlarının birçok eski dosya bilgileri ile örtüştüğü görülerek, önemli kanıtlara ulaşılmış ve şüphelilerin bir kısmı tutuklanmıştır. Yaşanan gelişmelerin duyulmasıyla bölge kamuoyunda sorumluların tespit edilip yargılanabileceği umudu doğmuştur. Bu nedenle 2009 yılında Cizre, Silopi ve İdil ilçelerinde pek çok aile Şırnak Barosu aracılığıyla ve gönüllü avukatların desteğiyle kendi kayıplarının da akıbetlerini öğrenebilmek ve sorumluların bulunması amacıyla uzun süredir hiçbir ilerleme olmamış kayıp dosyaları ile ilgili olarak savcılıklara yeniden başvuru yapmıştır.

30 Mart 2009 tarihinde CMK 250. Maddesinde Belirtilen Suçlara Bakmakla Yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından 2009/906 numaralı soruşturma kapsamında Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına yazılan yazıda Cizre’de 1990-2000 yılları arasında jandarma ve polis bölgelerinde meydana gelen faili meçhul cinayetler ve zorla kaybetmelerle ilgili ayrıntılı bir tablo hazırlanması, 1993-1994 yıllarına ait nezarethane kayıt defterlerinin ve aynı yıllara ait İlçe Jandarma Komutanlığı tarafından İl Jandarma Komutanlığına gönderilen vukuat raporlarının temin edilmesi, tanık M.N.B. ve gizli tanık Tükenmez Kalem’in beyanlarında yer alan olaylarla ilgili yürütülen soruşturma dosyalarından Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında bulunanlar kapsamında tanık beyanlarının yeniden alınması, fotoğraf teşhis ve fethi kabir işlemlerinin gerçekleştirilmesi, kimlik tespiti açısından gerekliyse biyolojik incelemelerin yapılması, mermi çekirdek ve kovanlarının gerekli kriminal incelemelerinin tamamlanması talep edilmişti.

31 Mart 2009 tarihinde Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 2009/430 numaralı soruşturma kapsamında bu taleplerin yerine getirilmesini Cizre İlçe Emniyet Müdürlüğü ve İlçe Jandarma Komutanlığından istemişti.

24 Nisan 2009 tarihinde Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından yürütülen 2009/430 numaralı soruşturma kapsamında CMK 250. Maddesinde Belirtilen Suçlara Bakmakla Yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına 30 Mart 2009 tarihli talebinin sonucu bildirilmişti.

2 Mayıs 2009 tarihinde, bu gelişmeler üzerine müşteki/mağdur H.Y., Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına, babası Abdurrahman Yılmaz'ın zorla kaybedilmesi olayı ile ilgili olarak şikâyet dilekçesi vermişti. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, Abdurrahman Yılmaz’ın öldürülmesi iddiasını 2009/430 numaralı soruşturma dosyası altında incelemeye başlamıştı. 22 Mayıs 2009 tarihinde H.Y. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında müşteki sıfatıyla ifadesini vermişti.

25 Mayıs 2009 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına müşteki H.Y. vekilince dilekçe verilmek suretiyle H.Y.’nin tekrar dinlenmesi istenmiş ve aynı gün H.Y. yeniden dinlenmiştir. H.Y. ikinci ifadesinde, Abdurrahman Yılmaz’ın Cizre Köprüsü üzerinde bekletilirken kemik renginde Toros marka araçla gelen dört-beş sivil kişi tarafından alınıp götürüldüğünü, olayı kendi mahallelerinde oturan H.D.’nin gördüğünü, bunu akrabalarına sorarak öğrendiğini ve bu kişinin tanık olarak dinlenmesini talep ettiğini belirtmişti. 26 Mayıs 2009 tarihinde, Abdurrahman Yılmaz’ın eşi A.Y. ve görgü tanığı H.D. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında tanık olarak dinlenmiştir. H.D. ifadesinde, H.Y.’nin iddialarını doğrulamıştır.

Müştekiler dilekçe ve ifadelerinde Abdurrahman Yılmaz'ın gözaltına alınarak daha sonra öldürülmesinde rol aldığından şüphelendikleri Cabbar kod adlı kişinin Cizre'den tanıdıkları bir ailenin kızı ile evlendiğini öğrendiklerini belirtip nüfus kayıtlarından gerekli araştırmanın yapılarak Cabbar kod adlı kişinin gerçek kimliğinin tespit edilmesini talep etmişlerdi. Savcılığın soruşturma dosyasına da giren kayıtlara göre, Cabbar kod adıyla bilinen kişinin muhtemel kimliği İ.Y. olarak tespit edilmişti.

25 Mart 2010 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, CMK 250. Maddesinde Belirtilen Suçlara Bakmakla Yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına 2009/430 numarası üzerinden yürütülen soruşturmaya ilişkin tahkikat aşamasını ve değerlendirmelerini göndermiştir. Buna göre öncelikle CMK 250. Maddesinde Belirtilen Suçlara Bakmakla Yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/906 numaralı soruşturma üzerinden yürüttüğü ve daha sonradan Cizre Cumhuriyet Başsavcılığınca yürütülen soruşturma dosyasının 2009/430 numarasına kaydedildiği belirtilmiştir. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı değerlendirmesinde, Abdurrahman Yılmaz’ın öldürülmesi iddiası ile ilgili elde edilen bilgiler ve değerlendirmeler paylaşılmıştı. 18 Mayıs 2012 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı ayırma kararı vermiştir. Buna göre CCMK 250. Maddesinde Belirtilen Suçlara Bakmakla Yetkili Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/906 numarası üzerinden yürütülen soruşturmanın Cizre Cumhuriyet Başsavcılığının 2009/430 numarası üzerinden yürütülmesine karar verilmiştir.

06 Şubat 2013 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 2009/430 numaralı soruşturmasını tamamlayarak, fezlekeyle TMK 10. Maddesi ile Görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığına göndermiştir. TMK 10. Maddesi ile Görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığında dosya 2013/466 soruşturma numarasına kaydedilmiştir.
20 Mart 2014 tarihinde, TMK 10. Maddesi ile Görevli Diyarbakır Cumhuriyet Başsavcılığı, 6526 sayılı yasanın 19. maddesi ile TMK 10. Maddesi ile Görevli Cumhuriyet Başsavcılıklarının görevine son verilmesi sebebiyle, yetkisizlik kararı vererek 2013/466 numaralı soruşturma dosyasını Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına göndermiş, dosya burada 2014/1859 sayılı soruşturma sırasına kaydedilmiştir.

18 Ekim 2014 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, 2014/1859-02 numaralı soruşturma dosyası kapsamında, Cizre Emniyet Müdürlüğüne yazdığı yazıda, aralarında Abdurrahman Yılmaz’ın da bulunduğu 21 maktulün öldürülmesi iddiasına ilişkin olarak; maktullerin ölümleri veya kaybolmaları iddiasına ilişkin olarak herhangi bir şüpheli tespit edilip edilmediği, tespit edilmişse bu şüpheli hakkında ne tür işlemler yapıldığının tespit edilmesi, kayıtların tetkiki ile maktullerin ölümleri veya kaybolmaları iddiasına ilişkin olarak Cizre Emniyet Müdürlüğüne herhangi bir şikayetin yapılıp yapılmadığı, yapılmışsa bu konuda ne tür işlemler yapıldığının tespiti, bu işlemler sırasında gerekiyorsa, maktul yakınları ile görüşülmesi ve yardım alınması, olay yerinin Jandarma bölgesinde bulunması halinde, gönderilen müzekkerenin iade edilmemesi ve Jandarma görevlileri ile koordinatlı bir şekilde bu işlemlerin yapılması, soruşturmaya konu olaya ilişkin olarak Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında 11 klasör halinde evraklar mevcut olup gerekirse irtibata geçilerek belgelerin tahsis edilmesi taleplerinde bulunmuştur.

Nisan 2015 tarihinde, Cizre Emniyet Müdürlüğü, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına, ilgili soruşturmaya ilişkin hazırladığı 30 Mart 2015 tarihli “Arşiv Araştırma Tutanağı”nı göndermiştir. Buna göre, soruşturma evrakına konu ölümlerin veya kaybolmaların akıbeti ile ilgili olarak Asayiş Büro Amirliği, Şehit Murat Akançay Polis Merkez Amirliği ve Cizre İlçe Jandarma Komutanlığı ile soruşturma konusuyla ilgili olarak gerekli araştırmanın yapılması için yazışmalar yapılmış, Şehit Murat Akançay Polis Merkez Amirliği ve Cizre İlçe Jandarma Komutanlığı ile yapılan yazışmalardan henüz yanıt gelmemiş, yanıt gelmesi halinde gönderileceği belirtilmiştir. Asayiş Büro Amirliğinin cevap yazısı ve TEM Büro Amirliği arşiv kayıtlarında yapılan araştırma neticesinde hazırlanan araştırma tutanağı gönderilmiştir. Araştırma tutanağında ise, Abdurrahman Yılmaz isimli şahıs hakkında arşiv kayıtlarında herhangi bir belge ve bilgiye rastlanmadığı ifade edilmiştir.

14 Mayıs 2015 tarihinde, Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı, ayrıca, 2014/1859 numaralı soruşturma dosyası kapsamında, Cizre İlçe Emniyet Müdürlüğünden; Abdurrahman Yılmaz isimli maktulün 1994 yılında Cizre ilçesinde öldürülmesi olayı ile ilgili olarak bugüne kadar herhangi bir fail tespit edilip edilmediği ve konu ile ilgili olarak herhangi bir kamu davası açılıp açılmadığının tespitini talep etmiştir.

Haziran 2023 itibariyle Cizre Cumhuriyet Başsavcılığında yapılan araştırma neticesinde Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı Toplu Dosyası 2014/1859 soruşturma numaralı dosyada olduğu görülmüştür. Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı 2014/1859 dosyasının 40’a yakın klasörden oluşuyordu. Savcılık arşivinden getirilen klasörlere bakıldığında ise son yıllarda yapılan işlemlere dair fiziki çıktıların dosyalara aktarılmadığı ve en son yapılan işlemlerin 2013-2014 yıllarında olduğu görüldü. Bu nedenle dosyanın fiziken incelemesi sonucunda alınan veriler eski işlemlere dairdir. Yeni olduğu söylenen klasörlerde ise 2019 yılına ait bir evraktan sonra tüm klasör tekrar 2013 yılına ait görülüyor.

Güncelleme sırasında savcılıktan belgelerin UYAP üzerinden kontrolü talebimiz kabul edilmesi üzerine en son eklenen evrak ve işlemlere UYAP üzerinden bakıldı.

Dosyada var olan maktül ve müştekilerin öğrenilmesi amacıyla sunulan talep sonucunda maktüller Abdülhakim Tanrıverdi, Abdullah Düşkün, Abdurrahman Güzel, Abdurrahman Yılmaz, Ahmet Berek, Ali Karagöz, Emin Savgat, Emin Karatay, Hediye Erbil, İhsan Arslan, Mahfuze Sezgin, Mehdiye Budak, Mehmet Elçi, Mehmet Turay, Mehmet Acar, Mehmet Sezgin, Mustafa Aydın, Mümine Yanık, Rabia Tanrikulu, Selami Çiçek, Yusuf Şahin; mağdurlar Abdulvahap Timurtaş, Abdurrahman Bilik, Ahmet Bulmuş, Enver Akın, Hasan Baykura, İlhan Bilir, Kemal Mübariz, Nadir Nayci, Ömer Sulmaz, Ramazan Bilir isimleri görüldü.

Dosyada yer alan bilgilere göre Cizre Cumhuriyet Başsavcılığı Hazırlık Bürosu 29 Haziran 2022 tarihinde 2014/1859 Cumhuriyet Başsavcılığı soruşturma dosyası üzerinden Cizre İlçe Emniyet Müdürlüğü Asayiş Büro Amirliğine “Herhangi bir şüpheli tespit edilip edilmediği, edildiyse yapılan işlemler, Şikayet olup olmadığı olmuşsa yapılan işlemlerin,” araştırılması için müzekkere yazmıştı. Bu araştırma işlemleri için maktül yakınları ile görüşülmesi ve yardım alınması istenmişti.

Savcılıkta yapılan inceleme ve savcılık katibinden alınan bilgiye göre dosyada henüz bir daimi arama kararı veya herhangi bir ayırma kararı olmadığı bilgisi alındı.

Dosyada en son 25 Ocak 2022 tarihinde Abdulhamit Düdük’ün öldürülmesi olayında elde edilen suç eşyalarının Cizre Cizre Cumhuriyet Başsavcılığına gönderildiği bilgisi Eskişehir 2. Ağır Ceza Mahkemesi 2015/47 dosyasınca bildirilmiştir. Dosya hakkında bilgiler Haziran 2023 itibariyle günceldir.